Japanse duizendknoop is een snelgroeiende plant die stengels maakt van 2 tot 3 meter lang in het groeiseizoen. Deze zijn opgebouwd uit holle delen en zijn groen met roodachtige vlekjes. De grote bladeren zijn lichtgroen en hartvormig. De plant bloeit in augustus en september met witte bloemen. In de winter sterft hij af, maar onder de grond gaat hij door met wortelstokken.